海关对出口货物原产地证书的申请和签发已基本实现电子化。签发的流程包括：维护企业基本信息，证书申报，原产地确认和证书签发。
（一）在海关办理原产地证书相关业务前先维护企业基本信息。方式：登录中国国际贸易“单一窗口”（https://www.singlewindow.cn/）-业务应用-口岸执法申报-原产地证-海关原产地证书或“海关政务服务”平台（http://online.customs.gov.cn/）-税费业务-原产地证书签发进入，点击企业基本信息-企业基本信息维护，进行录入操作。需要进行证书自助打印的企业，同时在原产地证书自助打印系统中完成企业电子印章及授权人员签名笔迹信息的上传和授权操作。
（二）维护企业基本信息后，企业可以登录中国国际贸易“单一窗口”或“海关政务服务”平台进行原产地证书的申请，依据不同原产地证书的填制规范对进出口双方信息、运输细节、商品描述、使用的原产地标准等信息进行如实申报。
（三）海关在审核原产地证书过程中，对原产地证书的真实性或产品是否符合原产地规则，必要时会进行确认。
（四）原产地证书审核通过后，对可自助打印的原产地证书，企业使用自动双面打印的彩色打印机在A4纸上自行打印原产地证书。对于尚未开通自助打印的原产地证书，企业须使用针式打印机在申领的空白证书上打印原产地证书，并加盖企业中英文印章、授权人员签字后，到签证海关现场办理证书签发手续。
